Vários museus históricos e outras instituições mantêm objetos do patrimônio ferroviário. Aqui estão relacionados alguns com locomotivas e vagões.
Barueri
Museu Municipal de Barueri
Avenida Henrique Gonçalves Baptista, 359
guarda e exibe um vagão de passageiros
Dumont
Museu Histórico e Pedagógico Santos Dumont
Praça Josefina Negri, 21
guarda e exibe uma locomotiva Baldwin
Mairiporã
Museu de Arqueologia Industrial Thomaz Cruz
Avenida Dr. Thomaz Rodrigues da Cruz, 1113
guarda e exibe uma locomotiva Baldwin e dois vagões
Olímpia
Museu de História e Folclore Maria Olímpia
Rua David de Oliveira, 420
guarda e exibe uma locomotiva
Penápolis
Museu Histórico e Pedagógico Gláucia Castilho Brandão
Praça 9 de Julho, 170
guarda e exibe um vagão de passageiros
Santos
Museu do Porto de Santos
Avenida Conselheiro Rodrigues Alves, s/n
guarda e exibe uma locomotiva
São Paulo
Museu Catavento
Avenida Mercúrio, s/n
guarda e exibe duas locomotivas a vapor e uma locomotiva elétrica do acervo da Fundação Museu da Tecnologia de São Paulo
São Paulo
Museu da Imigração
Rua Visconde de Parnaíba, 1316
apresenta plataforma da São Paulo Railway em parte da antiga Hospedaria de Imigrantes, construída nas décadas de 1880 e 1890
Outras instituições com objetos ferroviários
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